Proteomica se concentrează pe descrierea dinamică a reglării genelor, determinarea cantitativă a nivelurilor de proteine ale expresiei genelor, identificarea efectelor bolilor și medicamentelor asupra proceselor vieții și explicarea mecanismului de reglare a expresiei genice. Ca știință, cercetarea proteomică nu este de la zero Inițial, este o extensie a profilului proteinelor (peptide) și a tehnologiei de cartografiere a produselor genetice, care a fost utilizată de mai bine de 20 de ani. Cartarea peptidelor se bazează pe electroforeza bidimensională pe gel (2-DE) și pe o analiză ulterioară a imaginii; și genă Profilul produsului depinde de o varietate de analize după separare, cum ar fi spectrometria de masă, analiza compoziției aminoacizilor etc.
Datorită existenței editării variabile și a editării ARN, multe gene pot exprima o varietate de proteine diferite. Prin urmare, complexitatea proteomului este mult mai mare decât complexitatea genomului.
Dacă întreaga secvență genomică a unei specii a fost descifrată, nu înseamnă că și proteomul acelei specii a fost descifrat. Analiza specifică a produsului proteic al unei gene ar trebui determinată prin modificarea și reglarea cuprinzătoare a nivelului genomului, a nivelului de transcripție și a nivelului de traducere.